Emil i Lönneberga bor på gården Katthult i Lönneberga socken i Småland tillsammans med pappa, mamma, syster Ida och tjänstefolk. Tiden är omkring sekelskiftet.

Emil är en företagsam ung man. Han orsakar fler busstreck än det finns dagar på året.

I denna film hinner han bland annat med att hissa upp Ida i flaggstången, sticka huvudet i soppskålen så att han fastnar, hälla paltsmet över sin far, och fånga samme fader med en råttfälla. Mellan hyssen får han sitta i snickarboa och begrunda sina hyss. Under tiden i "fångenskap" täljer han på en präktig samling trägubbar.

Ett gott hjärta har han dock, Emil. Hjonen i Lönneberga fattigstuga får sig ett julkalas de aldrig ska glömma. Sin bäste supporter och trognaste vän har Emil i drängen Alfred.